Taksonomi adalah praktik mengidentifikasi organisme yang berbeda, mengklasifikasikannya ke dalam kategori, dan menamainya. Semua organisme, baik yang hidup maupun yang telah punah, diklasifikasikan ke dalam kelompok yang berbeda dengan organisme lain yang sejenis dan diberi nama ilmiah. Studi tentang nama-nama organisme disebut Nomenklatur.
Taksonomi adalah sub-disiplin Sistematika yang mempelajari hubungan tersebut. Kata taksonomi juga digunakan dalam konteks non-biologis untuk menggambarkan sistem klasifikasi apa pun. Nomenklatur adalah sub-disiplin taksonomi.
Ilmuwan yang mempelajari taksonomi disebut ahli taksonomi .
Ilmuwan Yunani, Aristoteles, adalah salah satu ilmuwan pertama yang mengatur makhluk hidup. Dia mengembangkan sistem klasifikasi pertama yang membagi semua organisme yang diketahui menjadi dua kelompok: Tumbuhan dan Hewan. Masing-masing kelompok utama ini kemudian dibagi menjadi tiga subkelompok yang lebih kecil.
Subkelompok hewan: Tanah, Air, Udara
Subkelompok tanaman: Kecil, Sedang, Besar
Ada kesenjangan dalam sistem klasifikasi Aristoteles. Ada begitu banyak organisme yang tidak cocok. Misalnya, katak lahir di air dan memiliki insang seperti ikan, tetapi setelah dewasa mereka memiliki paru-paru dan dapat hidup di darat. Lantas, bagaimana sistem klasifikasi Aristoteles mengklasifikasikan katak? Dalam sistem klasifikasi Aristoteles, burung, kelelawar, dan serangga terbang dikelompokkan bersama meskipun memiliki sedikit kesamaan kecuali bahwa mereka dapat terbang. Tapi pinguin adalah burung yang tidak bisa terbang, jadi Aristoteles tidak bisa mengklasifikasikan mereka sebagai burung.
Bahkan dengan banyaknya masalah, sistem klasifikasi Aristoteles digunakan selama hampir 2000 tahun hingga digantikan pada tahun 1700-an oleh ahli biologi Swedia Carolus Linnaeus (1707-1778).
Seperti Aristoteles, Linnaeus mengklasifikasikan organisme menurut sifatnya. Dia mengembangkan sistem taksonomi, yang disebut nomenklatur binomial yang digunakan di seluruh biologi. Sistem aslinya pertama kali diterbitkan pada tahun 1735 dengan judul Systema Naturae – dianggap sebagai 'kitab taksonomi'. Sistem telah berkembang dari waktu ke waktu tetapi pada dasarnya tetap sama.
Sistem klasifikasi Aristoteles dan Linnaeus dimulai dengan dua kelompok yang sama: Tumbuhan dan Hewan. Linnaeus menyebut kelompok ini 'kerajaan'. Tetapi tidak seperti Aristoteles, Linnaeus membagi kerajaan menjadi lima tingkatan - kelas, ordo, genus, spesies, dan variasi. Organisme ditempatkan pada tingkatan-tingkatan tersebut berdasarkan ciri-ciri, antara lain kesamaan bagian tubuh, bentuk fisik seperti ukuran, bentuk, dan cara mendapatkan makanan.
Dalam Systema Naturae , Linnaeus mengklasifikasikan alam ke dalam hierarki. Klasifikasi organisme memiliki berbagai kategori hierarkis. Kategori berangsur-angsur berubah dari sangat luas dan mencakup banyak organisme berbeda menjadi spesies tunggal yang sangat spesifik dan mengidentifikasi.
Dia mengusulkan bahwa ada tiga kelompok besar yang disebut kerajaan di mana seluruh alam dapat masuk. Kerajaan-kerajaan ini adalah hewan, tumbuhan, dan mineral. Dia membagi masing-masing kerajaan ini ke dalam kelas-kelas. Kelas dibagi menjadi ordo dan ordo dibagi lagi menjadi genus dan kemudian spesies. Kami masih menggunakan sistemnya hari ini tetapi kami telah membuat beberapa perubahan.
Saat ini, kami hanya menggunakan sistem ini untuk mengklasifikasikan makhluk hidup. Linnaeus memasukkan benda mati ke dalam kerajaan mineralnya. Selain itu, kami telah menambahkan beberapa level tambahan dalam hierarki.
Setiap tingkat klasifikasi disebut juga takson (jamak adalah taksa).
Tingkat kehidupan terluas sekarang menjadi domain. Domain adalah takson yang lebih besar dan lebih inklusif daripada kerajaan. Semua makhluk hidup hanya cocok dengan tiga domain: Archaea, Bakteri, dan Eukarya.
Di dalam masing-masing domain ini, ada kerajaan. Baik Bakteri dan Archaea terdiri dari prokariota bersel tunggal. Eukarya terdiri dari semua eukariota, dari protista bersel tunggal hingga manusia. Domain ini mencakup kerajaan Animalia (hewan), Plantae (tumbuhan), Fungi (jamur), dan Protista. Misalnya, Eukarya termasuk kerajaan Animalia, Fungi, Plantae, dan lainnya.
Setiap kerajaan berisi filum (filum tunggal). Itu masih merupakan klasifikasi yang sangat luas tetapi membagi kerajaan menjadi beberapa kelompok. Dalam kerajaan hewan, filum utama termasuk chordate (hewan dengan tulang punggung atau vertebrata), arthopoda (termasuk serangga) dan moluska (moluska seperti siput). Invertebrata dipisahkan menjadi banyak filum yang berbeda.
Setiap filum kemudian dibagi menjadi kelas-kelas. Kelas dalam filum chordate antara lain mamalia (mamalia), reptilia (reptil) dan osteichthyes (ikan). Kelas arthropoda termasuk serangga dan arakhnida (laba-laba, tungau, dan kalajengking).
Kelas tersebut kemudian dibagi lagi menjadi sebuah ordo. Di dalam kelas mamalia, contoh ordo termasuk cetacea (termasuk paus dan lumba-lumba), karnivora (karnivora), primata (monyet, kera, dan manusia) dan chiroptera (kelelawar).
Dari urutan tersebut, organisme akan diklasifikasikan ke dalam keluarga. Dalam urutan primata, keluarga termasuk hominidae (kera besar dan manusia), cercopithecidae (monyet dunia lama seperti babon0 dan hylobatidae (owa dan kera kecil).
Dua kategori terakhir adalah genus dan spesies. Genus dan spesies yang dimiliki suatu organisme adalah bagaimana suatu organisme menerima nama ilmiahnya. Sistem penamaan ini disebut 'nomenklatur binomial' yang ditemukan oleh ahli biologi Carl Linnaeus.
Salah satu fitur yang luar biasa dari Sistem Klasifikasi Linnaean adalah bahwa dua nama umumnya cukup untuk membedakan dari satu organisme ke organisme berikutnya. Contoh dalam famili primata adalah genus Homo untuk semua spesies manusia (misalnya Home sapiens) atau Pongo untuk genus orangutan (misalnya Pongo abelii) untuk orangutan Sumatera atau Pongo pygmaeus untuk orangutan Kalimantan.
Spesies yang teridentifikasi ditempatkan ke dalam kelompok tertentu di setiap kategori ini. Misalnya, klasifikasi taksonomi manusia adalah
Domain: Eukaryota
Kerajaan: Animalia
Filum: Chordata
Kelas: Mamalia
Ordo: Primata
Keluarga: Hominidae
Genus: Homo
Spesies: Homo sapiens
Untuk mengingat urutan hierarki taksonomi dari domain ke spesies, orang sering menggunakan mnemonik agar lebih mudah. Satu ungkapan yang baik untuk mengingat hierarki taksonomi adalah Dear King Philip Came Over For Good Soup.
Nomenklatur Binomial adalah metode yang kami gunakan untuk menamai secara unik setiap organisme berbeda di Bumi, hidup atau punah. Semua organisme memiliki nama ilmiah yang mencakup dua kata Latin. Kedua kata ini dibuat dari nama genus tempat spesies itu berada dan kata kedua untuk memisahkan masing-masing spesies dalam genus yang sama. Karenanya, nama ilmiah semua organisme dibuat dari nama genusnya dan nama spesifiknya.
Misalnya, nama ilmiah yang diberikan kepada manusia mencakup genusnya Homo dan nama spesifiknya sapiens. Nama keseluruhannya adalah Homo sapiens.
Saat menulis nama spesies, penting untuk diingat bahwa nama tersebut dalam bahasa Latin dan perlu dicetak miring atau digarisbawahi. Genus selalu menggunakan huruf besar, dan nama Genus dan Spesies harus digarisbawahi. Misalnya, nama ilmiah Tikus berekor pendek adalah Blarina brevicauda. Semua klasifikasi taksonomi lainnya seperti Keluarga, Perintah, dll harus dikapitalisasi.