Taxonomie is de praktijk van het identificeren van verschillende organismen, ze in categorieën indelen en ze een naam geven. Alle organismen, zowel levend als uitgestorven, worden ingedeeld in verschillende groepen met andere vergelijkbare organismen en krijgen een wetenschappelijke naam. De studie van de namen van organismen wordt nomenclatuur genoemd.
Taxonomie is een subdiscipline van Systematics, de studie van die relaties. Het woord taxonomie wordt ook gebruikt in niet-biologische contexten om elk classificatiesysteem te beschrijven. Nomenclatuur is een subdiscipline van taxonomie.
Wetenschappers die taxonomie bestuderen, worden taxonomen genoemd .
De Griekse wetenschapper Aristoteles was een van de eerste wetenschappers die levende wezens organiseerde. Hij ontwikkelde het eerste classificatiesysteem dat alle bekende organismen in twee groepen verdeelde: planten en dieren. Elk van deze hoofdgroepen werd vervolgens verdeeld in drie kleinere subgroepen.
Dierlijke subgroepen: Land, Water, Lucht
Plant subgroepen: Small, Medium, Large
Er waren hiaten in het classificatiesysteem van Aristoteles. Er waren zoveel organismen die niet pasten. Kikkers worden bijvoorbeeld in water geboren en hebben kieuwen als vissen, maar als ze opgroeien hebben ze longen en kunnen ze op het land leven. Dus, hoe classificeert het classificatiesysteem van Aristoteles kikkers? In het classificatiesysteem van Aristoteles werden vogels, vleermuizen en vliegende insecten gegroepeerd, hoewel ze weinig gemeen hebben, behalve dat ze kunnen vliegen. Maar pinguïns zijn een vogel die niet kan vliegen, dus Aristoteles kan ze niet als vogels hebben geclassificeerd.
Ondanks de vele problemen werd het classificatiesysteem van Aristoteles bijna 2000 jaar gebruikt totdat het in de 18e eeuw werd vervangen door de Zweedse bioloog Carolus Linnaeus (1707-1778).
Net als Aristoteles classificeerde Linnaeus organismen op basis van hun eigenschappen. Hij ontwikkelde het taxonomische systeem, binominale nomenclatuur genaamd, dat in de hele biologie wordt gebruikt. Zijn oorspronkelijke systeem werd voor het eerst gepubliceerd in 1735 onder de titel Systema Naturae – beschouwd als de 'bijbel van de taxonomie'. Het systeem is in de loop van de tijd geëvolueerd, maar blijft in wezen hetzelfde.
De classificatiesystemen van zowel Aristoteles als Linnaeus begonnen met dezelfde twee groepen: planten en dieren. Linnaeus noemde deze groepen 'koninkrijken'. Maar in tegenstelling tot Aristoteles verdeelde Linnaeus het koninkrijk in vijf niveaus: klasse, orde, geslacht, soort en variëteit. Organismen werden in deze niveaus geplaatst op basis van eigenschappen, waaronder overeenkomsten van lichaamsdelen, fysieke vorm zoals grootte, vorm en methoden om voedsel te krijgen.
In Systema Naturae classificeerde Linnaeus de natuur in een hiërarchie. De classificatie van organismen kent verschillende hiërarchische categorieën. Categorieën verschuiven geleidelijk van zeer breed en omvatten veel verschillende organismen naar zeer specifieke en identificerende afzonderlijke soorten.
Hij stelde voor dat er drie brede groepen waren, koninkrijken genaamd, waarin de hele natuur zou passen. Deze koninkrijken waren dieren, planten en mineralen. Hij verdeelde elk van deze koninkrijken in klassen. Klassen werden verdeeld in orden en orden werden verder onderverdeeld in geslacht en vervolgens in soorten. We hebben nog steeds zijn systeem vandaag, maar we hebben enkele wijzigingen aangebracht.
Tegenwoordig gebruiken we dit systeem alleen om levende wezens te classificeren. Linnaeus nam niet-levende dingen op in zijn mineralenrijk. We hebben ook een paar extra niveaus in de hiërarchie toegevoegd.
Elk classificatieniveau wordt ook wel een taxon genoemd (meervoud is taxa).
Het breedste niveau van leven is nu een domein. Een domein is een taxon dat groter en inclusiever is dan het koninkrijk. Alle levende wezens passen in slechts drie domeinen: Archaea, Bacteriën en Eukarya.
Binnen elk van deze domeinen zijn er koninkrijken. Zowel Bacteria als Archaea bestaan uit eencellige prokaryoten. Eukarya bestaat uit alle eukaryoten, van eencellige protisten tot mensen. Dit domein omvat de koninkrijken Animalia (dieren), Plantae (planten), Fungi (schimmels) en Protista. Eukarya omvat bijvoorbeeld de koninkrijken Animalia, Fungi, Plantae en meer.
Elk koninkrijk bevat phyla (enkelvoud phylum). Het is nog steeds een zeer brede classificatie, maar het verdeelt koninkrijken in meerdere groepen. Binnen het dierenrijk omvatten de belangrijkste phyla chordaten (dieren met een ruggengraat of gewervelde dieren), geleedpotigen (inclusief insecten) en weekdieren (weekdieren zoals slakken). Ongewervelde dieren zijn onderverdeeld in veel verschillende phyla.
Elk phylum wordt vervolgens onderverdeeld in klassen. Klassen binnen het chordaatphylum omvatten onder andere zoogdieren (zoogdieren), reptilia (reptielen) en osteichthyes (vissen). Arthropod-klassen omvatten insecten en spinachtigen (spinnen, mijten en schorpioenen).
De klas wordt vervolgens onderverdeeld in een volgorde. Binnen de klasse zoogdieren zijn voorbeelden van orde onder meer walvisachtigen (inclusief walvissen en dolfijnen), carnivoor (carnivoren), primaten (apen, apen en mensen) en chiroptera (vleermuizen).
Vanuit de bestelling wordt het organisme ingedeeld in een familie. Binnen de orde van primaten omvatten families hominidae (mensapen en mensen), cercopithecidae (oude wereldapen zoals bavianen0 en hylobatidae (gibbons en kleine mensapen).
De laatste twee categorieën zijn geslacht en soort. Het geslacht en de soort waartoe een organisme behoort, zijn hoe een organisme zijn wetenschappelijke naam ontvangt. Dit naamgevingssysteem wordt 'binominale nomenclatuur' genoemd, uitgevonden door de bioloog Carl Linnaeus.
Een opvallend kenmerk van het Linnaean-classificatiesysteem is dat twee namen over het algemeen voldoende zijn om van het ene organisme naar het andere te differentiëren. Een voorbeeld binnen de primatenfamilie is het geslacht Homo voor alle menselijke soorten (bijvoorbeeld Home sapiens) of Pongo voor het geslacht als orang-oetan (bijvoorbeeld Pongo abelii) voor de Sumatraanse orang-oetan of Pongo pygmaeus voor de Borneose orang-oetan.
Een geïdentificeerde soort wordt in elk van deze categorieën in een specifieke groep geplaatst. De taxonomische classificatie van mensen is bijvoorbeeld:
Domein: Eukaryota
Koninkrijk: Animalia
stam: Chordata
Klasse: Mammalia
Bestelling: Primaten
Familie: Hominidae
geslacht: homo
Soort: Homo sapiens
Om de volgorde van de taxonomische hiërarchie van domein tot soort te onthouden, gebruiken mensen vaak geheugensteuntjes om het gemakkelijker te maken. Een goede zin om de taxonomische hiërarchie te onthouden is Dear King Philip Came Over For Good Soup.
Binominale nomenclatuur is de methode die we gebruiken om elk ander organisme op aarde uniek te noemen, levend of uitgestorven. Alle organismen hebben een wetenschappelijke naam die twee Latijnse woorden bevat. Deze twee woorden zijn gemaakt van de namen van het geslacht waartoe de soort behoort en een tweede woord om elk van de soorten binnen hetzelfde geslacht te scheiden. Vandaar dat de wetenschappelijke namen van alle organismen zijn gemaakt van de naam van hun geslacht en een specifieke naam.
De wetenschappelijke naam die aan mensen wordt gegeven, omvat bijvoorbeeld hun geslacht Homo en de specifieke naam sapiens. De algemene naam is Homo sapiens.
Bij het schrijven van soortnamen is het belangrijk om te onthouden dat de namen in het Latijn zijn en cursief of onderstreept moeten worden. Het geslacht wordt altijd met een hoofdletter geschreven en zowel de geslachtsnaam als de soortnaam moeten worden onderstreept. De wetenschappelijke naam voor de kortstaartspitsmuis is bijvoorbeeld Blarina brevicauda. Alle andere taxonomische classificaties zoals Families, Orders, enz. moeten met een hoofdletter worden geschreven.
