Ang taxonomy ay ang pagsasanay ng pagtukoy ng iba't ibang organismo, pag-uuri sa kanila sa mga kategorya, at pagbibigay ng pangalan sa kanila. Ang lahat ng mga organismo, parehong nabubuhay at wala na, ay inuri sa mga natatanging grupo na may iba pang katulad na mga organismo at binigyan ng siyentipikong pangalan. Ang pag-aaral ng mga pangalan ng mga organismo ay tinatawag na Nomenclature.
Ang taxonomy ay isang sub-discipline ng Systematics na siyang pag-aaral ng mga relasyong iyon. Ginagamit din ang salitang taxonomy sa mga kontekstong hindi biyolohikal upang ilarawan ang anumang sistema ng pag-uuri. Ang nomenclature ay isang sub-discipline ng taxonomy.
Ang mga siyentipiko na nag-aaral ng taxonomy ay tinatawag na mga taxonomist .
Ang siyentipikong Griyego na si Aristotle ay isa sa mga unang siyentipiko na nag-organisa ng mga bagay na may buhay. Binuo niya ang unang sistema ng pag-uuri na hinati ang lahat ng kilalang organismo sa dalawang pangkat: Mga Halaman at Hayop. Ang bawat isa sa mga pangunahing grupo ay hinati sa tatlong mas maliliit na subgroup.
Mga subgroup ng hayop: Lupa, Tubig, Hangin
Mga subgroup ng halaman: Maliit, Katamtaman, Malaki
May mga puwang sa sistema ng pag-uuri ni Aristotle. Napakaraming organismo ang hindi magkasya. Halimbawa, ang mga palaka ay isinilang sa tubig at may mga hasang tulad ng isda, ngunit kapag sila ay lumaki ay mayroon silang mga baga at maaaring mabuhay sa lupa. Kaya, paano inuri ng sistema ng pag-uuri ni Aristotle ang mga palaka? Sa sistema ng pag-uuri ni Aristotle, ang mga ibon, paniki, at lumilipad na mga insekto ay pinagsama-sama kahit na may maliit na pagkakatulad maliban sa maaari silang lumipad. Ngunit ang penguin ay isang ibon na hindi maaaring lumipad, kaya't hindi maaaring iuri sila ni Aristotle bilang mga ibon.
Kahit na sa maraming problema, ginamit ang sistema ng pag-uuri ni Aristotle sa halos 2000 taon hanggang sa mapalitan ito noong 1700s ng Swedish biologist na si Carolus Linnaeus (1707-1778).
Tulad ni Aristotle, inuri ni Linnaeus ang mga organismo ayon sa kanilang mga katangian. Binuo niya ang taxonomic system, na tinatawag na binomial nomenclature na ginagamit sa buong biology. Ang kanyang orihinal na sistema ay unang inilathala noong 1735 sa ilalim ng pamagat na Systema Naturae – itinuturing na 'bibliya ng taxonomy'. Ang sistema ay umunlad sa paglipas ng panahon ngunit nananatiling mahalagang pareho.
Ang mga sistema ng pag-uuri ng parehong Aristotle at Linnaeus ay nagsimula sa parehong dalawang grupo: Mga Halaman at Hayop. Tinawag ni Linnaeus ang mga pangkat na ito na 'mga kaharian'. Ngunit hindi tulad ni Aristotle, hinati ni Linnaeus ang kaharian sa limang antas - klase, order, genus, species at variety. Ang mga organismo ay inilagay sa mga antas na ito batay sa mga katangian, kabilang ang pagkakatulad ng mga bahagi ng katawan, pisikal na anyo tulad ng laki, hugis, at mga paraan ng pagkuha ng pagkain.
Sa Systema Naturae , inuri ni Linnaeus ang kalikasan sa isang hierarchy. Ang pag-uuri ng mga organismo ay may iba't ibang hierarchical na kategorya. Ang mga kategorya ay unti-unting nagbabago mula sa pagiging napakalawak at kabilang ang maraming iba't ibang mga organismo tungo sa napaka-espesipiko at pagkilala sa iisang species.
Iminungkahi niya na mayroong tatlong malawak na grupo na tinatawag na mga kaharian kung saan maaaring magkasya ang buong kalikasan. Ang mga kaharian na ito ay mga hayop, halaman at mineral. Hinati niya ang bawat isa sa mga kahariang ito sa mga klase. Ang mga klase ay hinati sa mga order at ang mga order ay hinati pa sa genus at pagkatapos ay mga species. Tayo pa rin ang sistema niya ngayon pero may mga ginawa tayong pagbabago.
Sa ngayon, ginagamit lamang natin ang sistemang ito upang pag-uri-uriin ang mga bagay na may buhay. Kasama ni Linnaeus ang mga bagay na walang buhay sa kanyang kaharian ng mineral. Gayundin, nagdagdag kami ng ilang karagdagang antas sa hierarchy.
Ang bawat antas ng pag-uuri ay tinatawag ding taxon (pangmaramihang ay taxa).
Ang pinakamalawak na antas ng buhay ay isang domain na ngayon. Ang domain ay isang taxon na mas malaki at mas inklusibo kaysa sa kaharian. Ang lahat ng nabubuhay na bagay ay magkasya sa tatlong domain lamang: Archaea, Bacteria, at Eukarya.
Sa loob ng bawat domain na ito, may mga kaharian. Ang parehong Bacteria at Archaea ay binubuo ng single-celled prokaryotes. Ang Eukarya ay binubuo ng lahat ng eukaryotes, mula sa mga single-celled na protista hanggang sa mga tao. Kasama sa domain na ito ang Animalia (hayop), Plantae (halaman), Fungi (fungi), at Protista na mga kaharian. Halimbawa, kasama sa Eukarya ang mga kaharian na Animalia, Fungi, Plantae at higit pa.
Ang bawat kaharian ay naglalaman ng phyla (singular phylum). Isa pa rin itong napakalawak na klasipikasyon ngunit hinahati nito ang mga kaharian sa maraming grupo. Sa loob ng kaharian ng hayop, ang pangunahing phyla ay kinabibilangan ng chordate (mga hayop na may gulugod o vertebrates), arthopoda (kabilang ang mga insekto) at mollusca (mga mollusk tulad ng mga snails). Ang mga invertebrate ay pinaghihiwalay sa maraming iba't ibang phyla.
Ang bawat phylum ay nahahati sa mga klase. Kasama sa mga klase sa loob ng chordate phylum ang mammalia (mammals), reptilia (reptile) at osteichthyes (isda), bukod sa iba pa. Kasama sa mga klase ng Arthropod ang mga katulad ng mga insekto at arachnid (mga spider, mites, at alakdan).
Pagkatapos, ang klase ay nahahati sa isang order. Sa loob ng klaseng mammalian, ang mga halimbawa ng kaayusan ay kinabibilangan ng cetacea (kabilang ang mga balyena at dolphin), carnivore (carnivore), primates (unggoy, unggoy, at tao) at chiroptera (panig).
Mula sa pagkakasunud-sunod, ang organismo ay mauuri sa isang pamilya. Sa pagkakasunud-sunod ng mga primata, ang mga pamilya ay kinabibilangan ng hominidae (mga dakilang unggoy at tao), cercopithecidae (mga lumang unggoy sa daigdig gaya ng mga baboon0 at hylobatidae (gibbons at mas mababang apes).
Ang huling dalawang kategorya ay genus at species. Ang genus at species na kinabibilangan ng isang organismo ay kung paano natatanggap ng isang organismo ang pangalang siyentipiko nito. Ang sistema ng pagbibigay ng pangalan na ito ay tinatawag na 'binomial nomenclature' na imbento ng biologist na si Carl Linnaeus.
Ang isang natatanging tampok ng Sistema ng Pag-uuri ng Linnaean ay ang dalawang pangalan sa pangkalahatan ay sapat na upang magkaiba mula sa isang organismo patungo sa susunod. Ang isang halimbawa sa loob ng primate family ay ang genus Homo para sa lahat ng species ng tao (halimbawa, Home sapiens) o Pongo para sa genus kung orangutan (halimbawa Pongo abelii) para sa Sumatran orangutan o Pongo pygmaeus para sa Bornean orangutan.
Ang isang natukoy na species ay inilalagay sa isang partikular na grupo sa bawat isa sa mga kategoryang ito. Halimbawa, ang taxonomic classification ng mga tao ay
Domain: Eukaryota
Kaharian: Animalia
Phylum: Chordata
Klase: Mammalia
Order: Primates
Pamilya: Hominidae
Genus: Homo
Uri: Homo sapiens
Upang matandaan ang pagkakasunud-sunod ng taxonomic hierarchy mula sa domain hanggang sa mga species, ang mga tao ay madalas na gumagamit ng mnemonics upang gawing mas madali. Isang magandang pariralang dapat tandaan ang taxonomic hierarchy ay ang Mahal na Haring Philip ay Dumating Para sa Mabuting Sopas.
Ang Binomial Nomenclature ay ang paraan na ginagamit namin upang natatanging pangalanan ang bawat iba't ibang organismo sa Earth, nabubuhay o wala na. Ang lahat ng mga organismo ay may siyentipikong pangalan na kinabibilangan ng dalawang salitang Latin. Ang dalawang salitang ito ay ginawa mula sa mga pangalan ng genus na kinabibilangan ng mga species at isang pangalawang salita upang paghiwalayin ang bawat isa sa mga species sa loob ng parehong genus. Samakatuwid, ang mga siyentipikong pangalan ng lahat ng mga organismo ay ginawa mula sa pangalan ng kanilang genus at isang tiyak na pangalan.
Halimbawa, kasama sa siyentipikong pangalan na ibinigay sa mga tao ang kanilang genus na Homo at ang partikular na pangalang sapiens. Ang pangkalahatang pangalan ay Homo sapiens.
Kapag nagsusulat ng mga pangalan ng species, mahalagang tandaan na nasa Latin ang mga pangalan at kailangang itali o may salungguhit. Palaging naka-capitalize ang Genus, at dapat na may salungguhit ang mga pangalan ng Genus at Species. Halimbawa, ang siyentipikong pangalan para sa Short-tailed shrew ay Blarina brevicauda. Ang lahat ng iba pang klasipikasyon ng taxonomic tulad ng Mga Pamilya, Mga Order, atbp ay dapat na naka-capitalize.
